涎腺多形性腺瘤p53基因突变的聚合酶链式反应--单股构型多态分析研究

2007-12-14 14:12  来源:现代口腔医学杂志
作者:王洁 阅读量:1037

  【摘要】 目的 检测涎腺多形性腺瘤中p53基因突变。方法 采用非同位素聚合酶链式反应--单股构型多态分析(PCR-S SCP)技术对涎腺多形性腺瘤进行研究。结果 14例多形性腺瘤中有11 例出现PCR-SSCP异常电泳带(阳性率78.6%)。突变部位分布在第5~8外显子,其中第5、 6、7、8外显子的阳性例数分别为2、6、7、3例。在11例阳性肿瘤中有2例肿瘤同时出现3对 外显子(第6、7、8外显子)异常;3例肿瘤同时出现2对外显子(第6、7和7、8外显子)异常。 结论 ①涎腺多形性腺瘤发生中p53基因的第5~8外显子均有突变, 其中突变频率最高的是外显子6和7;②在阳性的肿瘤中约有半数出现多位点突变。
  【关键词】 多形性腺瘤  基因  突变 p53  PCR-SSCP

  大多数上皮源性肿瘤p53基因点突变是最常见的突变方式[1, 2]。为确定涎腺多形性腺瘤中p53基因突变的方式和位点,应用非同位素PCR-SSCP方法对 多形性腺瘤进行研究。

材料和方法

  一、标本:取自近期手术切除的涎腺多形性腺瘤14例,正常腮腺组织2例。所有新鲜标本立即经-196℃液氮速冻15分钟,置-70℃冰柜存放。
  二、DNA提取:取100mg新鲜冷冻组织,剪碎后置研磨器内,加入1ml DNA提取液(100mM NaCl;10mM Tris-HCl;25mM EDTA;0.5%SDS),冰水中研磨组织成匀浆,吸入1.0ml Eppendrof管中,加入40μl蛋白酶K(10mg/ml)。50℃~55℃水浴4小时(或37℃水浴过夜)。取出Eppendrof管置4℃冰箱。加入等体积饱和酚,摇荡10分钟,离心5000rpm,5分钟。取上清液,加入等体积饱和酚/氯仿/异戊醇(25/24/1),振荡5分钟,离心5000rpm,5分钟。取上清液,加入等体积氯仿/异戊醇(24/1),振荡5分钟,离心5000rpm,5分钟。取上清液加入1/10体积的3mol/L醋酸钠,逐渐加入二倍体积的冰无水乙醇。出现白色絮状物后,吸出置另一干净 Eppendrof管内,加入少量80%乙醇,离心,倒掉乙醇,置4℃冰箱凉干。TE溶解,置-20℃冰 箱保存。
  三、聚合酶链式反应(PCR):①引物设计:p53基因点突变主要位于4个保守区,即外显子5、 6、7、8。4对引物分别扩增了含有易突变位点的p53基因的4个DNA片段。引物序列见附表。 ②PCR扩增:PCR反应体系(25μl)中模板DNA 2μl(300ng/μl),4×dNTP 2μl(2.5mM/μl),10×PCR缓冲液2.5μl(含MgCl 15mM/ml),引物P1和P2各0.5μl(86μg/μl),无菌三蒸水17μl。95℃水浴变性5分钟后加入Taq DNA聚合酶0.5μl(3U/μl),充分混匀,加矿物油(美国Sigma公司)1~2滴。DNA扩增仪(美国PE公司480型)内40次循环(94 ℃变性1分钟,55℃退火1分20秒,72℃延伸2分钟),反应完成后,取5μl PCR产物经1.5% 琼脂糖凝胶电泳鉴定扩增产物。

附表 p53基因PCR扩增引物序列
 

外显子引物序列(5′→3′)产物长度
5P1
P2
TAC
ATC
TCC
GCT
CCT
ATC
GCC
TGA
CTC
GCA
AAC
GCG
AAG
CTC
A
A
150bp
6P1
P2
GTC
CTC
TGG
AGG
CCC
CGG
CTC
CTC
CTC
ATA
AGC
GGG
ATC
CAC
 112bp
7P1
P2
GTT
CTG
GGC
GAG
TCT
TCT
GAC
TCC
TGT
AGT
ACC
GTG
ACC
ATG
 110bp
8P1
P2
TGG
CTC
TAA
GCA
TCT
TAG
ACT
TGC
GGG
TCC
ACG
CTG
GAA
GG
C
130bp

  四、单股构型多态分析(SSCP):取5μl PCR产物,加入 5μl SSCP上样液(95%去离子甲酰胺,20mM/L EDTA,0.05%溴酚蓝,0.05%二甲苯晴 蓝),混匀。98℃变性8分钟,冰水骤冷,立即上样进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(丙烯酰 胺:甲基丙烯酰胺=60:1),1×TBE为电泳缓冲液,50V,30mA恒电流电泳8~10小时,电泳 至溴酚蓝接近凝胶底部时结束。
  五、银染:凝胶揭下后置银染固定液(30%乙醇,10%乙酸)中固定4~12小时,30%乙醇洗2次,各30分钟;三蒸水漂洗3次;0.1%硝酸银染液染色30分;少许三蒸水洗涤;银染显色液(2.5%碳酸钠,0.02%甲醛)显色10分钟,直至条带清晰;终止液(1%乙酸)终止3分钟;少许三蒸水漂洗5分钟,封干保存,照像。

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编辑: 姚红祥

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